MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli O157:H7 EDL933 plasmid pO157

Total Repeats: 1753

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007414	GA	3	6	50	55	50 %	0 %	50 %	0 %	75994448
2	NC_007414	CAT	2	6	78	83	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75994448
3	NC_007414	CAC	2	6	90	95	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	75994448
4	NC_007414	CCA	2	6	97	102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	75994448
5	NC_007414	AGC	2	6	138	143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75994448
6	NC_007414	GGC	2	6	159	164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	75994448
7	NC_007414	A	7	7	165	171	100 %	0 %	0 %	0 %	75994448
8	NC_007414	TGG	2	6	247	252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	75994448
9	NC_007414	ATT	2	6	258	263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	75994448
10	NC_007414	TG	3	6	401	406	0 %	50 %	50 %	0 %	75994448
11	NC_007414	TGCC	2	8	420	427	0 %	25 %	25 %	50 %	75994448
12	NC_007414	AGG	3	9	467	475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	75994448
13	NC_007414	CCG	2	6	507	512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	75994448
14	NC_007414	TGA	2	6	549	554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75994448
15	NC_007414	A	7	7	560	566	100 %	0 %	0 %	0 %	75994448
16	NC_007414	TGGA	2	8	787	794	25 %	25 %	50 %	0 %	75994449
17	NC_007414	GACT	2	8	837	844	25 %	25 %	25 %	25 %	75994449
18	NC_007414	GCA	2	6	846	851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75994449
19	NC_007414	A	6	6	909	914	100 %	0 %	0 %	0 %	75994449
20	NC_007414	AAT	2	6	949	954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75994449
21	NC_007414	AT	3	6	1159	1164	50 %	50 %	0 %	0 %	75994450
22	NC_007414	TAT	2	6	1173	1178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	75994450
23	NC_007414	TG	3	6	1200	1205	0 %	50 %	50 %	0 %	75994450
24	NC_007414	GTT	2	6	1223	1228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75994450
25	NC_007414	GGT	2	6	1332	1337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	75994450
26	NC_007414	GACA	2	8	1339	1346	50 %	0 %	25 %	25 %	75994450
27	NC_007414	TGA	2	6	1347	1352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75994450
28	NC_007414	GAAT	2	8	1443	1450	50 %	25 %	25 %	0 %	75994450
29	NC_007414	CCGGG	2	10	1468	1477	0 %	0 %	60 %	40 %	75994450
30	NC_007414	GCC	2	6	1478	1483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	75994450
31	NC_007414	ACA	2	6	1500	1505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	75994450
32	NC_007414	TGC	2	6	1515	1520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75994450
33	NC_007414	ACA	2	6	1543	1548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	75994450
34	NC_007414	C	6	6	1583	1588	0 %	0 %	0 %	100 %	75994450
35	NC_007414	TAAA	2	8	1606	1613	75 %	25 %	0 %	0 %	75994450
36	NC_007414	A	6	6	1662	1667	100 %	0 %	0 %	0 %	75994451
37	NC_007414	TCA	2	6	1703	1708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75994451
38	NC_007414	A	6	6	1722	1727	100 %	0 %	0 %	0 %	75994451
39	NC_007414	CAG	3	9	1782	1790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75994451
40	NC_007414	ACC	2	6	1791	1796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	75994451
41	NC_007414	ATT	2	6	1914	1919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	75994452
42	NC_007414	ATT	2	6	1938	1943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	75994452
43	NC_007414	CGG	2	6	2054	2059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	75994452
44	NC_007414	ATG	2	6	2065	2070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75994452
45	NC_007414	TTC	2	6	2107	2112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	75994452
46	NC_007414	AGGC	2	8	2127	2134	25 %	0 %	50 %	25 %	75994452
47	NC_007414	CTG	2	6	2172	2177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75994452
48	NC_007414	ACA	2	6	2202	2207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	75994452
49	NC_007414	GCT	2	6	2211	2216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75994452
50	NC_007414	CAG	2	6	2217	2222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75994452
51	NC_007414	CAGA	2	8	2489	2496	50 %	0 %	25 %	25 %	75994453
52	NC_007414	TG	4	8	2729	2736	0 %	50 %	50 %	0 %	75994453
53	NC_007414	ATG	2	6	2737	2742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75994453
54	NC_007414	CTT	2	6	2993	2998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	75994454
55	NC_007414	GCTC	2	8	3004	3011	0 %	25 %	25 %	50 %	75994454
56	NC_007414	CAA	2	6	3052	3057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	75994455
57	NC_007414	GCT	2	6	3261	3266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75994455
58	NC_007414	CAC	2	6	3321	3326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	75994455
59	NC_007414	CTG	2	6	3359	3364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75994455
60	NC_007414	TACC	2	8	3429	3436	25 %	25 %	0 %	50 %	75994455
61	NC_007414	CCGA	2	8	3472	3479	25 %	0 %	25 %	50 %	75994455
62	NC_007414	TGC	2	6	3504	3509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75994455
63	NC_007414	GC	3	6	3541	3546	0 %	0 %	50 %	50 %	75994455
64	NC_007414	CAGA	2	8	3664	3671	50 %	0 %	25 %	25 %	75994455
65	NC_007414	CGT	2	6	3706	3711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75994455
66	NC_007414	CGT	2	6	3826	3831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75994455
67	NC_007414	GCG	2	6	4277	4282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	75994456
68	NC_007414	ACA	2	6	4308	4313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	75994456
69	NC_007414	CA	3	6	4312	4317	50 %	0 %	0 %	50 %	75994456
70	NC_007414	AAC	2	6	4320	4325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	75994456
71	NC_007414	CCCT	2	8	4370	4377	0 %	25 %	0 %	75 %	75994456
72	NC_007414	GCCCC	2	10	4393	4402	0 %	0 %	20 %	80 %	75994456
73	NC_007414	TGT	2	6	4442	4447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75994456
74	NC_007414	CAA	2	6	4838	4843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	75994457
75	NC_007414	GCC	2	6	4897	4902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	75994457
76	NC_007414	GGGTT	2	10	4920	4929	0 %	40 %	60 %	0 %	75994457
77	NC_007414	AGG	3	9	4961	4969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	75994457
78	NC_007414	CTG	2	6	5170	5175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75994458
79	NC_007414	CA	3	6	5349	5354	50 %	0 %	0 %	50 %	75994458
80	NC_007414	AAT	2	6	5443	5448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75994459
81	NC_007414	GCA	2	6	5569	5574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75994459
82	NC_007414	ATAGAT	2	12	5614	5625	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	75994459
83	NC_007414	A	7	7	5693	5699	100 %	0 %	0 %	0 %	75994459
84	NC_007414	CTGC	2	8	5727	5734	0 %	25 %	25 %	50 %	75994459
85	NC_007414	T	7	7	6024	6030	0 %	100 %	0 %	0 %	75994460
86	NC_007414	AGC	2	6	6032	6037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75994460
87	NC_007414	TGA	2	6	6042	6047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75994460
88	NC_007414	GAC	2	6	6094	6099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75994460
89	NC_007414	TTA	2	6	6159	6164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	75994460
90	NC_007414	GTG	2	6	6326	6331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	75994460
91	NC_007414	TG	3	6	6480	6485	0 %	50 %	50 %	0 %	75994460
92	NC_007414	TGC	2	6	6524	6529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75994460
93	NC_007414	CAG	2	6	6548	6553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75994460
94	NC_007414	GGC	2	6	6606	6611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	75994460
95	NC_007414	GCA	2	6	6632	6637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75994460
96	NC_007414	ACC	2	6	6660	6665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	75994460
97	NC_007414	TGC	2	6	6716	6721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75994460
98	NC_007414	CAG	2	6	6745	6750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75994460
99	NC_007414	T	6	6	6824	6829	0 %	100 %	0 %	0 %	75994461
100	NC_007414	CAC	2	6	6857	6862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	75994461
101	NC_007414	TG	3	6	6863	6868	0 %	50 %	50 %	0 %	75994461
102	NC_007414	GTT	2	6	6945	6950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75994461
103	NC_007414	CCAG	2	8	6954	6961	25 %	0 %	25 %	50 %	75994461
104	NC_007414	CTG	2	6	6979	6984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75994461
105	NC_007414	TCCG	2	8	7029	7036	0 %	25 %	25 %	50 %	75994461
106	NC_007414	GCC	2	6	7071	7076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	75994462
107	NC_007414	TCA	2	6	7147	7152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75994462
108	NC_007414	AGA	2	6	7166	7171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	75994462
109	NC_007414	AAG	2	6	7198	7203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	75994462
110	NC_007414	GCA	2	6	7221	7226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75994462
111	NC_007414	T	6	6	7267	7272	0 %	100 %	0 %	0 %	75994462
112	NC_007414	GTA	2	6	7277	7282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75994462
113	NC_007414	A	8	8	7378	7385	100 %	0 %	0 %	0 %	75994463
114	NC_007414	TTC	2	6	7401	7406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	75994463
115	NC_007414	A	6	6	7448	7453	100 %	0 %	0 %	0 %	75994463
116	NC_007414	CTA	2	6	7468	7473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75994463
117	NC_007414	CTC	2	6	7494	7499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	75994463
118	NC_007414	G	6	6	7530	7535	0 %	0 %	100 %	0 %	75994463
119	NC_007414	CCA	2	6	7551	7556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	75994463
120	NC_007414	A	6	6	7586	7591	100 %	0 %	0 %	0 %	75994463
121	NC_007414	TGG	2	6	7625	7630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	75994463
122	NC_007414	CTTT	2	8	7656	7663	0 %	75 %	0 %	25 %	75994463
123	NC_007414	ATG	2	6	7704	7709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75994463
124	NC_007414	GTG	2	6	7725	7730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	75994463
125	NC_007414	A	6	6	7814	7819	100 %	0 %	0 %	0 %	75994463
126	NC_007414	GAAGA	2	10	7914	7923	60 %	0 %	40 %	0 %	75994463
127	NC_007414	ACA	2	6	7959	7964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	75994463
128	NC_007414	GCC	2	6	8015	8020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	75994463
129	NC_007414	TTAT	2	8	8034	8041	25 %	75 %	0 %	0 %	75994463
130	NC_007414	GAT	2	6	8126	8131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75994463
131	NC_007414	GAG	2	6	8132	8137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	75994463
132	NC_007414	GGA	2	6	8236	8241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	75994463
133	NC_007414	AAAT	2	8	8260	8267	75 %	25 %	0 %	0 %	75994463
134	NC_007414	GAA	2	6	8356	8361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	75994463
135	NC_007414	TA	3	6	8364	8369	50 %	50 %	0 %	0 %	75994463
136	NC_007414	A	6	6	8423	8428	100 %	0 %	0 %	0 %	75994463
137	NC_007414	TGA	2	6	8478	8483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75994463
138	NC_007414	ACG	2	6	8489	8494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75994463
139	NC_007414	ACC	2	6	8534	8539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	75994463
140	NC_007414	GCG	2	6	8684	8689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	75994463
141	NC_007414	TGAT	2	8	8700	8707	25 %	50 %	25 %	0 %	75994463
142	NC_007414	AAT	2	6	8828	8833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75994463
143	NC_007414	GAA	2	6	8893	8898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	75994463
144	NC_007414	A	6	6	8939	8944	100 %	0 %	0 %	0 %	75994463
145	NC_007414	GAAA	2	8	8955	8962	75 %	0 %	25 %	0 %	75994463
146	NC_007414	TGC	2	6	8998	9003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75994463
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148	NC_007414	CAG	2	6	9120	9125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75994463
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154	NC_007414	CTG	2	6	9335	9340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75994463
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157	NC_007414	GAT	2	6	9494	9499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75994463
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159	NC_007414	G	6	6	9684	9689	0 %	0 %	100 %	0 %	75994464
160	NC_007414	AGA	2	6	9701	9706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	75994464
161	NC_007414	TGA	2	6	9710	9715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75994464
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164	NC_007414	GAT	2	6	9801	9806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75994464
165	NC_007414	TGA	2	6	9854	9859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75994464
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169	NC_007414	CAT	2	6	10276	10281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75994465
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171	NC_007414	ATC	2	6	10355	10360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75994465
172	NC_007414	GTT	2	6	10392	10397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75994465
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174	NC_007414	TAC	2	6	10488	10493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75994465
175	NC_007414	TTAC	2	8	10580	10587	25 %	50 %	0 %	25 %	75994465
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181	NC_007414	CGA	2	6	10969	10974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75994465
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269	NC_007414	CGG	2	6	16710	16715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	75994470
270	NC_007414	GCG	2	6	16938	16943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	75994471
271	NC_007414	GAT	2	6	17029	17034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75994471
272	NC_007414	TCT	2	6	17037	17042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	75994471
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274	NC_007414	ATC	2	6	17357	17362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75994472
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278	NC_007414	GAT	2	6	17524	17529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75994472
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288	NC_007414	T	6	6	18092	18097	0 %	100 %	0 %	0 %	75994472
289	NC_007414	TAAT	2	8	18138	18145	50 %	50 %	0 %	0 %	75994472
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293	NC_007414	A	6	6	18475	18480	100 %	0 %	0 %	0 %	75994473
294	NC_007414	TG	3	6	18523	18528	0 %	50 %	50 %	0 %	75994473
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391	NC_007414	TGT	2	6	23905	23910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75994477
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397	NC_007414	AAC	2	6	24429	24434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	75994477
398	NC_007414	GATGG	2	10	24445	24454	20 %	20 %	60 %	0 %	75994477
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400	NC_007414	CAAA	2	8	24492	24499	75 %	0 %	0 %	25 %	75994477
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404	NC_007414	T	7	7	24644	24650	0 %	100 %	0 %	0 %	75994477
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436	NC_007414	ATA	2	6	26322	26327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75994478
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